Marijan Rupert studirao je komparativnu književnost i sociologiju kulture na Filozofskom fakultetu u Ljubljani. Uvijek ga je zanimao odnos književnosti i likovne umjetnosti. Magistrirao je na temu Ut pictura poesis kod prof. dr. Brate Rotar. Nakon diplome studirao je teoriju romana kod mentora Milana Kundere u Parizu i usavršavao se u Beču uz razne stipendije. Od 1994. zaposlen je u Nacionalnoj in sveučilišnoj knjižnici u Ljubljani, od 2006. do 2019. kao voditelj, zatim kao upravitelj Zbirke rukopisa. U svom radu bavi se književnom poviješću u praksi: arhivi i ostavštine književnih stvaralaca, s kojima radi, daju mu specifičan, nadasve osobniji uvid u živote književnika, a ujedno i u genezu ili stvaranje svojih književnih djela.

Priredio je veliki broj izložbi i na mnogima od njih stručno sudjelovao, uglavnom na temu slovenske književne i kulturne povijesti, kako u Nacionalnoj i Sveučilišnoj knjižnici tako i drugdje (Moderna galerija, Narodna galerija, Cankarjev dom, Plečnikova kuća, Gradski muzej). ). Surađivao je s mnogim institucijama (Institut za književnost i znanosti o književnosti ZRC SAZU, Filozofski fakultet, muzeji, knjižnice, Društvo za domaća istraživanja, Literaturhaus (Beč)…) u raznim istraživačkim i izložbenim projektima. Objavljuje eseje, studije u katalozima, popratne riječi, stručnu publicistiku u časopisima i novinama, sudjeluje u snimanju dokumentarnih filmova, a problematiku književne baštine predstavlja referatima i predavanjima na simpozijima u zemlji i inozemstvu.